航空工程学院是广西蓝天航空职业学院最具航空航天特色的院系之一，致力于培养飞机的“保健医生”。共设有飞机部件修理、飞机机电设备维修、民航通信技术、航空地面设备维修、机场运行、计算机运用技术等六个专业，所设专业定位准确、针对性强、市场急需、就业前景好。
该学院拥有实力雄厚的校内外实训基地。设有校内飞机发动机实训室、机载设备实训室、电工电子实训室，负责航空机务技能实操培训和金工实习。
此外与南宁吴圩机场，桂林两江机场，柳州白莲机场、北海机场等广西各大机场以及上汽通用五菱、江苏恒科、厦门福莱帕特等知名企业合作，共建校外实训基地9个。
建有从航空工程基础训练、专业实验、机电技能训练到生产实习等一套完整的实践培训体系。通过学校、行业、企业三方联动，实现学院、企业、学生共赢的目标，有效实现了学生高质量就业与创业，保障学生毕业后顺利走上工作岗位。
航空工程学院具有鲜明的培养特色，拥有雄厚的专业航空教师资源，深厚的实践经验、事故案例和数据积累以及丰富的航空机电专业文献等，为各专业构建起一个庞大而先进的实践教学平台。
主要培养能从事飞机维护、飞机和发动机修理、航线维修、航空器维修保养、航空部件维修、航空材料管理、企业资料管理、交通信息系统等方面工作的高技能应用型人才。在人才培养方案制订中注重学生综合素质和实践能力的培养，秉承“素质教育、知识、技能”的育人理念，按照“全素质、宽基础、重实践、强能力”的培养标准和“学历+技能+证书”的培养模式，着力培养学生以德立人，以技立才。致力于以提升就业竞争力和提高就业率，全面提高学生的专业技能和综合素质，为促进学生全面健康成长成才起到了很大的作用。
在教学过程中以学生为主体、加强课程的改革力度,充分调动学生积极性,学生的综合素质和职业技能水平不断提高,毕业生深受用人单位欢迎。各专业的培养方案均符合教育部和中国民航局相关法规要求，学生在校期间就有机会获得民航机务维修基础理论认证、机务维修基本技能认证、民航大型客机发动机航线维护培训证书、民航机务维修基础执照和计算机相关证书。
该学院具有丰富多彩的第二课堂活动。十分注重学生创新精神和实践能力的培养，学生通过完成贴近实际工作的教学任务，学习专业知识、掌握专业技能；通过参加各类国家、省级技能大赛，以赛促学、以赛促练，学生综合素质、工作能力极大提高。该系毕业生的综合素质一直得到用人单位的普遍赞誉，学生大多成为技术骨干和管理精英。